
La iglesia es otro de los puntos donde se han producido hallazgos relevantes que han afectado, lógicamente, al desarrollo de las obras. En la iglesia se han encontrado restos de dos antiguas criptas en la zona más cercana a la Sala Capitular, aunque por su mal estado no se ha considerado viable mantenerlas de cara al futuro.
En la zona del altar, sin embargo, sí se ha podido realizar una excavación arqueológica y como resultado se han hallado al menos dos de los tres altares que se han ubicado allí y la cripta principal, para la que se plantea una posible solución museográfica (más detalles en otro post).
La cubierta de la iglesia debe ser sustituida y al ser una operación de gran envergadura ha exigido unos trabajos previos, como la colocación de una gran grúa en el claustro, la preparación del terreno para el tránsito de camiones con material y el apoyo de la sobrecubierta de protección.